Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCM9Q9NXL9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCM9Q9NXL9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms