Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK13-1Q9NX77 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms