Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM140Q9NV12 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM140Q9NV12 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms