Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT13Q9NUP7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms