Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PDS5BQ9NTI5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms