Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPRD1BQ9NQG5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms