Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCRT2Q9NQ03 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCRT2Q9NQ03 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCRT2Q9NQ03 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms