Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE2TQ9NPD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2TQ9NPD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms