Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLCO1B3Q9NPD5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms