Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC134Q9H6E4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC134Q9H6E4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.9 ms