Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms