Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC8Q9H0W5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC8Q9H0W5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms