Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HOXD1Q9GZZ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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HOXD1Q9GZZ0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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HOXD1Q9GZZ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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