Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CEP295Q9C0D2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CEP295Q9C0D2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms