Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INO80BQ9C086 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INO80BQ9C086 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms