Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM5Q9C035 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM5Q9C035 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms