Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM6Q9C030 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM6Q9C030 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms