Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC11CQ9BY50 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms