Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RNF17Q9BXT8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RNF17Q9BXT8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF17Q9BXT8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms