Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLVAPQ9BX97 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLVAPQ9BX97 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms