Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM14BQ9BX40 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM14BQ9BX40 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms