Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NICN1Q9BSH3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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