Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SIKE1Q9BRV8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms