Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIOK1Q9BRS2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms