Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
FYCO1Q9BQS8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FYCO1Q9BQS8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms