Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SGIP1Q9BQI5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SGIP1Q9BQI5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGIP1Q9BQI5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms