Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3AQ99856 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3AQ99856 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms