Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRQ99707 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRQ99707 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRQ99707 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRQ99707 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRQ99707 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRQ99707 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRQ99707 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms