Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUFY1Q96T51 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RUFY1Q96T51 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms