Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SORCS2Q96PQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SORCS2Q96PQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms