Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM20AQ96MK3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM20AQ96MK3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms