Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMTD1Q96MG8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMTD1Q96MG8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms