Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C12orf42Q96LP6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C12orf42Q96LP6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms