Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TPD52L3Q96J77 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms