Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHDQ96IW2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHDQ96IW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHDQ96IW2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms