Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM52Q96A61 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM52Q96A61 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms