Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC47Q96A33 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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