Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UTP4Q969X6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms