Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAVIN3Q969G5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAVIN3Q969G5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms