Protein–RNA interactions for Protein: Q93050

ATP6V0A1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A1Q93050 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V0A1Q93050 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V0A1Q93050 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms