Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABGGTAQ92696 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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