Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPIRE2Q8WWL2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPIRE2Q8WWL2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms