Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSMEM1Q8WWF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms