Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
BRK1Q8WUW1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms