Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC7Q8WUI4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms