Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMG8Q8ND04 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMG8Q8ND04 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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