Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF169Q8NCN4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF169Q8NCN4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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