Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF38AQ8NAV1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms