Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF1Q8N6C5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF1Q8N6C5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms