Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VWDEQ8N2E2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VWDEQ8N2E2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms